Offizielle Bezeichnung: Universitätsklinikum Düsseldorf
Postanschrift: Moorenstraße 5
Ort: Düsseldorf
NUTS-Code: DEA11 Düsseldorf, Kreisfreie Stadt
Postleitzahl: 40225
Land: Deutschland
Kontaktstelle(n): Herr Alexander Emsbach
E-Mail:
Telefon: +49 211/81-19301
Internet-Adresse(n):
Hauptadresse: https://www.uniklinik-duesseldorf.de/

Einrichtung des öffentlichen Rechts

Gesundheit

NovaSeq X Plus Sequencing System

Referenznummer der Bekanntmachung: 061/23

Lieferauftrag

Das UKD beabsichtigt die Beschaffung eines Hochdurchsatzsequenziergeräts mit Analyseplattform "NovaSeq X Plus Sequencing System".

Aufteilung des Auftrags in Lose: nein

Wert ohne MwSt.: 1 274 341.60 EUR

NUTS-Code: DEA11 Düsseldorf, Kreisfreie Stadt

An der medizinischen Fakultät der Heinrich-Heine-Universität wurde ein hoher Bedarf für Hochdurchsatz-Sequenzierungen von short-reads für die Felder Humangenetik, Kinderonkologie, Onkologie, Pathologie, Frauenheilkunde, Neuropathologie, Gastroenterologie und Medizinische Mikrobiologie festgestellt. Besondere Anwendungen sind Analysen von Exomen, Genomen, Transkriptomen und Mikrobiomen (omics-Analysen). Für die notwendige Sequenziertiefe ist ein Hochdurchsatz-Sequenzierungsgerät, das kosteneffizient und schnell geforderte Datenmengen produziert, unerlässlich. Daran gekoppelt ist eine Bio-IT-Plattform notwendig, um die vom Hochdurchsatzsequenziergerät generierten Primärdaten schnell und präzise zu verarbeiten (Demultiplexing, Alignment). Des Weiteren soll die Bio-IT-Plattform rechenintensive standardmäßig durchgeführte Sekundäranalysen der Sequenzdaten prozessieren können. Dies beinhaltet zum Beispiel die Detektion von Keimbahn- sowie somatischen Variationen aus Exom- und Genomdaten, ebenso wie die Analyse von Transkriptomdaten (Transkriptquantifizerung, Genfusionen) und metagenomischen Daten, die für die beteiligten Akteure von großer Wichtigkeit sind.

Preis

Optionen: nein

Der Auftrag steht in Verbindung mit einem Vorhaben und/oder Programm, das aus Mitteln der EU finanziert wird: nein

Auftragsvergabe ohne vorherige Bekanntmachung eines Aufrufs zum Wettbewerb im Amtsblatt der Europäischen Union (für die unten aufgeführten Fälle)

Erläuterung:

Zusammenfassung der wichtigsten Alleinstellungsmerkmale des NovaSeq X plus mit on-site DRAGEN v4

a) Das Hochdurchsatzsequenziergerät nutzt die vor allem schnellere Sequenziertechnologie XLEAP-SBS

b) Flexibilität bei der Fließzellbelegung: Die acht verschiedenen Lanes der einzelnen Fließzellen können individuell beladen werden. Dies erlaubt die Aufteilung der Fließzelle für verschiedene Projekte/Fragestellungen und reduziert außerdem den notwendigen DNA-Input pro Probe. So kann eine hohe Diversität der vorgesehenen Proben sequenzieren werden und Proben höchst flexibel nach Dringlichkeit abgearbeitet werden.

c) Geringere Sequenzierkosten: Die Reduzierung der Sequenzierkosten liegt bei ca. 50%, wenn man die Kosten der Sequenzierkits auf die prognostizierte Datenmenge bezieht.

d) Kürzere Bearbeitungszeiten: Proben mit hoher Dringlichkeit z.B. für viele onkologische Fragestellungen und schwerkranke Neugeborene können schneller sequenziert werden, da sich die Laufzeit im Vergleich zum Vorgängermodell um fast die Hälfte verkürzt hat.

e) Geringerer Bedarf an Lager- und Kühlraumfläche, da einige notwendige Sequenzierchemikalien lyophylisiert vorliegen.

f) Optimierte Datenverarbeitungsstruktur: In das neue Gerät NovaSeq X Plus wurden vier Bio-IT-Analyseplattformen (DRAGEN Server) integriert, über die die BCL Konvertierung der Rohdaten in lesbare Sequenzdateien mit Qualitätsinformationen (fastq) läuft. Ebenso können limitierte, standardisierte Auswertungen der Daten darüber erfolgen. Dies lässt Kapazitäten frei werden auf einer separaten on-premise Bio-IT-Plattform, auf der spezifische Workflows individuell angepasst werden können. Mit der neuesten Version (v4 statt v3) wurden Prozesse beschleunigt und eine höhere Genauigkeit erzielt.

Weitere Vorteile für die Universitätsklinik Düsseldorf bei der Beschaffung eines NovaSeq X plus mit on-site DRAGEN v4 von Illumina

• Support und Service von Illumina sind im näheren Umfeld vorhanden.

• Die Kompatibilität zu am UKD existierenden Illumina Sequenziergeräten ist hoch, so dass die Mitarbeiter ausschließlich für die Neuerung dieses Geräts geschult werden müssen, nicht aber grundsätzlich für die Arbeitsweise von Illumina-Geräten und nicht für die eigentliche Probenvorbereitung.

• Nach einer umfassenden Marktanalyse des Auftraggebers hat sich herausgestellt, dass das Unternehmen Illumina GmbH das einzige Unternehmen ist, das ein Gerät anbietet, welches alle o.g. Anforderungen erfüllt.

Der Auftrag fällt unter das Beschaffungsübereinkommen: ja

27/06/2023

Der Auftrag wurde an einen Zusammenschluss aus Wirtschaftsteilnehmern vergeben: nein

Offizielle Bezeichnung: Illumina GmbH
Postanschrift: Eichhornstr. 3
Ort: Berlin
NUTS-Code: DE300 Berlin
Postleitzahl: 10785
Land: Deutschland
Internet-Adresse: www.illumina.com

Der Auftragnehmer/Konzessionär wird ein KMU sein: nein

Gesamtwert des Auftrags/des Loses/der Konzession: 1 127 341.60 EUR

Offizielle Bezeichnung: Vergabekammer Rheinland c/o Bezirksregierung Köln
Postanschrift: Zeughausstraße 2-10
Ort: Köln
Postleitzahl: 50667
Land: Deutschland
E-Mail:
Telefon: +49 221147-3055
Fax: +49 221147-2889

Offizielle Bezeichnung: Vergabekammer Rheinland c/o Bezirksregierung Köln
Postanschrift: Zeughausstraße 2-10
Ort: Köln
Postleitzahl: 50667
Land: Deutschland
E-Mail:

16/07/2023