Beschaffung eines Spatial Molecular Imager (SMI)
Bekanntmachung vergebener Aufträge
Ergebnisse des Vergabeverfahrens
Lieferauftrag
Abschnitt I: Öffentlicher Auftraggeber
Postanschrift:[gelöscht]
Ort: Frankfurt am Main
NUTS-Code: DE712 Frankfurt am Main, Kreisfreie Stadt
Postleitzahl: 60438
Land: Deutschland
Kontaktstelle(n):[gelöscht]
E-Mail: [gelöscht]
Telefon: [gelöscht]
Fax: [gelöscht]
Internet-Adresse(n):
Hauptadresse: https://www.gen.mpg.de/
Abschnitt II: Gegenstand
Beschaffung eines Spatial Molecular Imager (SMI)
Für die Max-Planck-Forschungsstelle für Neurogenetik wird im Zuge der Covid-19 Forschung ein Spatial Molecular Imager (SMI) beschafft. Der Spatial Molecular Imager (SMI) ist eine neuartige In-situ-Technologie (Eigentum von NanoString), die die Leistungsfähigkeit von High-Plex-Profiling mit hochauflösender Bildgebung kombiniert und es Forschern ermöglicht, die Expression von Proteinen und Genexpression in formalin-fixierten, paraffineingebetteten (FFPE) oder frisch gefrorenen (FF) Gewebeschnitten auf einem Objektträger zu visualisieren. Dieser dient für Untersuchungszwecke u. a. hinsichtlich der Riechschleimhaut von Covid-19 Patienten. Das Gerät ist einzigartig und es gibt keine vergleichbare Technologie auf dem Markt.
Max-Planck-Forschungsstelle für Neurogenetik
Max-von-Laue-Str. 4
60438 Frankfurt am Main
Für die Max-Planck-Forschungsstelle für Neurogenetik wird im Zuge der Covid-19 Forschung eine Spatial Molecular Imager (SMI) beschafft.
Spatial Molecular Imager (SMI): hochkomplexe RNA-Profilierung von interessierenden Regionen auf histologischen Trägern, die mit einem Antikörper oder einer RNA-Sonde angefärbt wurden, mit Einzelzell-Auflösung.
Der Spatial Molecular Imager bietet die einzigartige Möglichkeit zur Durchführung von Einzelzell-Transkriptomik von interessierenden Regionen auf histologischen Objektträgern, die durch einen Antikörper (Immunhistochemie) und/oder eine RNA-Sonde (RNAscope) definiert sind. Derzeit kann ein 1013-Plex-Sonden-Panel verwendet werden, von denen 980 fest vorgegeben sind und 33 auf Kundenwünschen basieren.
Wir verwenden seit 2010 die NanoString nCounter/SPRINT Genexpressionsplattform. Unseres war das erste Gerät, das in Deutschland installiert wurde. Es bietet uns eine hervorragende analytische Leistung für die Multiplex-Genexpression in Massen-RNA-Proben aus Geweben oder Organen. Allerdings geht die räumliche Information verloren.
Im Jahr 2020 haben wir einen Digital Spatial Profiler von NanoString erworben. Unsere Ergebnisse wurden kürzlich in Cell as Khan et al. "Visualisieren mittels gestorbener COVID-19-Patienten, wie SARS-CoV-2 die Schleimhäute der Atemwege und des Riechorgans angreift aber den Riechkolben verschont". Daher freuen wir uns sehr darauf, den nächsten Schritt zu machen und die Multiplex Genexpression in Regionen von Interesse durchzuführen. Dabei konzentriert sich unsere Forschung weiterhin auf das olfaktorische System von Maus und Mensch, insbesondere auf die Riechschleimhaut von COVID-19-Patienten.
Die außergewöhnliche Gelegenheit, die Expression von 1013 Genen in Hunderten von Zellen quantitativ in histologischen Präparaten zu messen, bietet den dringend benötigten räumlichen Kontext zur Bewertung der Auswirkungen von SARS-CoV-2 auf nahe gelegene, nicht infizierte Zellen, insbesondere auf olfaktorische Neuronen (die nicht infiziert sind) in der unmittelbaren Umgebung von Stützzellen (dem Hauptzelltyp von SARS-CoV-2 in der Riechschleimhaut).
Abschnitt IV: Verfahren
- Die betreffenden Erzeugnisse werden gemäß den in der Richtlinie genannten Bedingungen ausschließlich für Forschungs-, Versuchs-, Untersuchungs- oder Entwicklungszwecke hergestellt
- Die Bauleistungen/Lieferungen/Dienstleistungen können aus folgenden Gründen nur von einem bestimmten Wirtschaftsteilnehmer ausgeführt werden:
- nicht vorhandener Wettbewerb aus technischen Gründen
Für die Max-Planck-Forschungsstelle für Neurogenetik wird im Zuge der Covid-19 Forschung eine Spatial Molecular Imager (SMI) beschafft. Dieser dient für Untersuchungszwecke u. a. hinsichtlich der Riechschleimhaut von Covid-19 Patienten.
Der Spatial Molecular Imager (SMI) ist eine neuartige In-situ-Technologie (Eigentum von NanoString), die die Leistungsfähigkeit von High-Plex-Profiling mit hochauflösender Bildgebung kombiniert und es Forschern ermöglicht, die Expression von Proteinen und Genexpression in formalin-fixierten, paraffineingebetteten (FFPE) oder frisch gefrorenen (FF) Gewebeschnitten auf einem Objektträger zu visualisieren.
Im Gegensatz zu den meisten derzeitigen Einzelzellanalysetechnologien, die auf dissoziierten Zellen angewendet werden, ermöglicht SMI den Forschern die Analyse von Hunderten bis Tausenden von RNAs oder Proteine direkt aus einzelnen Zellen, bis hin zur subzellulären Auflösung, in morphologisch intakten Gewebeproben. Dies bietet eine höhere Multiplexing-Kapazität (mehr als 1.000 Targets) mit räumlichem Kontext aus formalin-fixierten, in Paraffin eingebetteten (FFPE) oder frisch gefrorenen (FF) Gewebeschnitten. Die SMI-Plattform ist ein integriertes System mit ausgereifter zyklischer In-situ-Hybridisierung, einem ultrahochauflösenden Bildauslesegerät und einer interaktiven Datenanalyse und Visualisierungssoftware. Die Probenvorbereitung umfasst standardmäßige in situ Hybridisierung (ISH) und ermöglicht die direkte Verwendung von Standard-Glasobjektträgern aus der Pathologie ohne Gewebeexpansion oder Reinigung und erfordert keine cDNA-Synthese oder Amplifikation. RNA- oder Protein-Targets in einzelnen Zellen werden durch Hybridisierung der Targets mit spezifischen Sonden oder Antikörpern identifiziert, die mit einem einzigartigen Barcode-System markiert sind, gefolgt vom Auslesen des Barcodes mit zyklischen Runden von fluoreszenzmarkierten Reportersonden. Jede RNA erscheint als einzelner Fleck in den Zellen und wird digital durch Zählen der Anzahl der abgebildeten Spots quantifiziert. Alle Daten werden dann in einen Cloud-Speicher migriert, wo die Nutzer Analyse- und Visualisierungstools zur Verfügung gestellt werden und auch die Möglichkeit haben, benutzerdefinierte Analyse-Workflows einzubinden.
Das Gerät ist einzigartig und es gibt keine vergleichbare Technologie auf dem Markt. Der Spatial Molecular Imager (SMI) ist nur bei NanoString Technologies, Inc. erhältlich.
Abschnitt V: Auftragsvergabe
CosMx Spatial Molecular Imager (SMI) Instrument
Ort: Seattle, WA
NUTS-Code: US United States
Land: Vereinigte Staaten
Abschnitt VI: Weitere Angaben
Postanschrift:[gelöscht]
Ort: München
Postleitzahl: 80538
Land: Deutschland
Ort: München
Land: Deutschland